復合肥生產線的工藝流程通常可分為：原料配料、原料攪拌、原料造粒、顆粒烘干、顆粒冷卻、顆粒篩分、成品包膜、及成品包裝。

復合肥原料適應性廣，適用于復混肥料、醫藥、化工、飼料等各種原料的造粒，產品成粒率高。能生產各種濃度，多種類型（包括有機肥、無機肥、生物肥、磁化肥等）復混肥。

簡易的復合肥生產工藝流程和復合肥生產線只需用一臺對輥擠壓造粒機即可，其他環節可用人力替代，這適合產量很小的項目，不過隨著規模的逐漸發展，可以逐步添加設備，實現更大產量的復合肥生產。